Prédire l’avenir est peut-être hors de notre portée, mais qu’en est-il de la prédiction de la progression des maladies ? Des chercheurs japonais se sont plongés dans le génome humain pour étudier un outil de prédiction de l’évolution de la polyarthrite rhumatoïde (PR), une maladie inflammatoire auto-immune qui se manifeste par des lésions articulaires progressives.
Dans une nouvelle étude publiée dans Arthritis & Rheumatology, des chercheurs dirigés par la Tokyo Medical and Dental University (TMDU) ont utilisé les données d’une étude d’association pangénomique (GWAS) sur la susceptibilité à la PR pour construire un score de risque polygénique (PRS). Ils ont évalué la capacité du PRS à prédire la progression radiographique (dommages anatomiques progressifs évalués par imagerie radiographique) chez les personnes atteintes de PR.
Dans le cadre d’une étude d’association pangénomique, l’analyse génomique d’un groupe d’individus est réalisée afin d’identifier les variantes génétiques qui peuvent être associées à un certain trait ou à une certaine maladie. Un PRS peut être généré à partir d’un ensemble de données GWAS et représente le risque d’un individu de développer une maladie spécifique en fonction de la somme des variants génétiques associés à cette maladie. Des études antérieures ont identifié des facteurs génétiques associés à la progression radiographique de la PR, notamment la présence d’anticorps anti-protéines citrullinées (ACPA) et de variantes situées dans la région de l’antigène leucocytaire humain (HLA) du chromosome humain qui contribuent à la régulation du système immunitaire. Cependant, l’exactitude prédictive de ces facteurs n’est pas robuste. C’est pourquoi l’équipe de recherche dirigée par la TMDU a entrepris d’évaluer la capacité d PRS à prédire la progression radiographique chez les personnes atteintes de PR.
“Nous avons généré le PRS à l’aide de statistiques sommaires provenant d’une analyse GWAS de la susceptibilité à la PR et évalué les lésions articulaires radiographiques de manière rétrospective à partir des dossiers médicaux des patients.” A déclaré Suguru Honda, auteur principal.
Les chercheurs ont ensuite effectué une analyse statistique pour évaluer s’il existe une association entre le PRS et la gravité de la progression radiographique. En outre, l’équipe de recherche a effectué une analyse multivariable pour évaluer l’association entre la progression radiographique et la combinaison du PRS et d’autres facteurs tels que le sexe, l’âge d’apparition et la présence d’ACPA ou de variantes de la région HLA.
“Nos analyses ont révélé une association entre le PRS et la progression radiographique“, explique l’auteur principal Yuta Kochi. “Le PRS différait significativement entre les groupes de progression sévère et non sévère“.
Les chercheurs ont constaté que les patients présentant un PRS plus élevé avaient un risque plus élevé de progression sévère, en particulier chez les personnes plus jeunes. En outre, l’analyse multivariable a révélé que l’association du PRS avec la progression radiographique n’est pas influencée par d’autres facteurs cliniques. Ainsi, le PRS pourrait être utilisé pour prédire la progression radiographique. Ces résultats soulignent les applications potentielles du profilage génétique dans le développement d’approches de médecine de précision pour le traitement de la PR.
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