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    Variante du SRAS-CoV-2: hypothèse du patient immunodéprimé

    Une nouvelle variante a récemment vu le jour au Royaume-Uni. Jusqu’à présent, la seule chose que nous savons à ce sujet est physique, c’est-à-dire que les sites où les acides aminés constituent le matériel génétique du SRAS-CoV-2 ont changé ou ont été modifiés ou perdus. Tout le reste n’est que des hypothèses que les chercheurs étudient ou des affirmations scientifiquement infondées.

    À l’heure actuelle, sur la base de preuves empiriques, nous ne savons toujours pas si cette mutation modifie la capacité de transmission du SRAS-CoV-2, bien que des analyses mécanistes suggèrent que cela est possible. Il en va de même pour la gravité de la maladie ou l’origine de cette variante. C’est sur ce point que nous allons nous concentrer brièvement. Une hypothèse semble dominer la genèse de cette nouvelle souche de SRAS-CoV-2: celle de l’infection chronique d’un patient immunodéprimé.

    Histoire de sélection

    La mutation est l’essence même du virus. En permanence, ce dernier mute plus ou moins au cours des phases de réplication virale, ceci à la suite d’erreurs ou en raison des pressions de son environnement évolutif. Les mutations peuvent aussi être induites par des protéines antivirales présentes chez les personnes infectées. Enfin, elles peuvent survenir par recombinaison, une sorte de « brassage » génétique. Cependant, jusqu’ici aucun signe de recombinaison n’a été détecté pour le SARS-CoV-2.

    Par conséquent, ce n’est pas le premier variant que nous voyons apparaître dans la lignée du SRAS-CoV-2. Cependant, c’est le premier mutant avec un si grand nombre de mutations. Comment expliquer ce phénomène ?

    L’hypothèse actuellement prédominante dans la communauté scientifique est celle de l’infection chronique chez les patients immunodéprimés. En fait, chez ces types de patients, nous essayons d’aider le système immunitaire en transfusant des anticorps à partir du sang des patients guéris. Cette technique médicale, en plus de la présence anormalement prolongée du virus dans l’organisme, pourrait exercer une sélection plus forte sur le virus, ce qui entraînerait des variations plus importantes de son ARN.

    Plusieurs patients de ce type ont été identifiés

    Grâce à deux articles publiés dans la revue Cell et dans le New England Journal of Medicine, on sait qu’au moins deux patients ont eu une infection prolongée par le SRAS-CoV-2 tout en recevant des anticorps par transfusion sanguine. Il y en avait certainement d’autres dont les infections n’étaient pas rapportées dans la littérature scientifique. Les analyses réalisées sur ces patients sont conformes à l’hypothèse de sélection. En fait, chez ces deux patients, l’infection anormalement longue et les différentes méthodes, qui fournissent des anticorps pour obtenir la clairance virale, provoquent plus de mutations et de délétions au fil du temps.

    Source :

    PMC US National Library of Medicine
    National Institutes of Health

    Image by Gerd Altmann

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